MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Cyanothece sp. PCC 7822 plasmid Cy782201

Total Repeats: 14762

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_014533	T	8	8	2405	2412	0 %	100 %	0 %	0 %	307591952
2	NC_014533	TGC	2	6	2455	2460	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	307591952
3	NC_014533	CGA	2	6	2496	2501	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	307591952
4	NC_014533	GTTCAA	2	12	2554	2565	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	307591952
5	NC_014533	TCG	2	6	2583	2588	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	307591952
6	NC_014533	AAATA	2	10	2600	2609	80 %	20 %	0 %	0 %	307591952
7	NC_014533	AGC	2	6	2624	2629	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	307591952
8	NC_014533	T	6	6	2732	2737	0 %	100 %	0 %	0 %	307591952
9	NC_014533	AGA	2	6	2738	2743	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	307591952
10	NC_014533	GA	3	6	2753	2758	50 %	0 %	50 %	0 %	307591952
11	NC_014533	TAA	2	6	2864	2869	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	307591952
12	NC_014533	T	6	6	2883	2888	0 %	100 %	0 %	0 %	307591952
13	NC_014533	AG	3	6	3095	3100	50 %	0 %	50 %	0 %	307591952
14	NC_014533	TTG	2	6	3110	3115	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	307591952
15	NC_014533	TG	3	6	3293	3298	0 %	50 %	50 %	0 %	307591952
16	NC_014533	ATG	2	6	3321	3326	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	307591952
17	NC_014533	A	6	6	3363	3368	100 %	0 %	0 %	0 %	307591952
18	NC_014533	CAT	2	6	3388	3393	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	307591952
19	NC_014533	AAT	2	6	3439	3444	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	307591952
20	NC_014533	TAA	2	6	3554	3559	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	307591952
21	NC_014533	ATT	2	6	3620	3625	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	307591953
22	NC_014533	TGAT	2	8	3628	3635	25 %	50 %	25 %	0 %	307591953
23	NC_014533	TGA	2	6	3700	3705	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	307591953
24	NC_014533	CAG	2	6	3809	3814	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	307591953
25	NC_014533	G	7	7	3916	3922	0 %	0 %	100 %	0 %	307591953
26	NC_014533	TAA	2	6	3942	3947	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	307591953
27	NC_014533	AAC	2	6	4255	4260	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	307591953
28	NC_014533	CCAA	2	8	4266	4273	50 %	0 %	0 %	50 %	307591953
29	NC_014533	AAC	2	6	4318	4323	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	307591953
30	NC_014533	AGT	2	6	4442	4447	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	307591953
31	NC_014533	CTT	2	6	4520	4525	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	307591953
32	NC_014533	CAT	2	6	4581	4586	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	307591953
33	NC_014533	AGA	2	6	4740	4745	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	307591953
34	NC_014533	CTT	2	6	4760	4765	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	307591953
35	NC_014533	CTAT	2	8	4840	4847	25 %	50 %	0 %	25 %	307591953
36	NC_014533	GTA	2	6	4849	4854	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	307591953
37	NC_014533	AG	3	6	4933	4938	50 %	0 %	50 %	0 %	307591953
38	NC_014533	TGC	2	6	4982	4987	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	307591953
39	NC_014533	GGA	2	6	5138	5143	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	307591953
40	NC_014533	ATT	2	6	5157	5162	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	307591953
41	NC_014533	T	6	6	5234	5239	0 %	100 %	0 %	0 %	307591953
42	NC_014533	GTCG	2	8	5249	5256	0 %	25 %	50 %	25 %	307591953
43	NC_014533	CAA	2	6	5288	5293	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	307591953
44	NC_014533	TGT	2	6	5346	5351	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	307591953
45	NC_014533	GTT	2	6	5451	5456	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	307591953
46	NC_014533	GAA	2	6	5583	5588	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	307591953
47	NC_014533	GGC	2	6	5649	5654	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	307591953
48	NC_014533	TTGT	2	8	5691	5698	0 %	75 %	25 %	0 %	307591953
49	NC_014533	TGG	2	6	5836	5841	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	307591953
50	NC_014533	AACC	2	8	5851	5858	50 %	0 %	0 %	50 %	307591953
51	NC_014533	TC	3	6	5881	5886	0 %	50 %	0 %	50 %	307591953
52	NC_014533	GACT	2	8	5936	5943	25 %	25 %	25 %	25 %	307591953
53	NC_014533	ATCGTC	2	12	5970	5981	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	307591953
54	NC_014533	AGC	2	6	5995	6000	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	307591953
55	NC_014533	CGAT	2	8	6030	6037	25 %	25 %	25 %	25 %	307591953
56	NC_014533	TTC	2	6	6042	6047	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	307591953
57	NC_014533	TTC	2	6	6111	6116	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	307591953
58	NC_014533	ATA	2	6	6376	6381	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	307591953
59	NC_014533	CAA	3	9	6401	6409	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	307591953
60	NC_014533	GAT	2	6	6410	6415	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	307591953
61	NC_014533	TTC	2	6	6579	6584	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	307591953
62	NC_014533	CCA	2	6	6675	6680	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	307591953
63	NC_014533	TGC	2	6	6703	6708	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	307591953
64	NC_014533	GCA	2	6	6754	6759	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	307591953
65	NC_014533	AGG	2	6	6780	6785	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	307591953
66	NC_014533	AAG	2	6	6847	6852	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	307591953
67	NC_014533	AAAGAC	2	12	7029	7040	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	307591953
68	NC_014533	GTGC	2	8	7096	7103	0 %	25 %	50 %	25 %	307591953
69	NC_014533	TCC	2	6	7132	7137	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	307591953
70	NC_014533	ATCG	2	8	7230	7237	25 %	25 %	25 %	25 %	307591953
71	NC_014533	TCG	2	6	7282	7287	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	307591953
72	NC_014533	AGCG	2	8	7300	7307	25 %	0 %	50 %	25 %	307591953
73	NC_014533	AATA	2	8	7444	7451	75 %	25 %	0 %	0 %	307591953
74	NC_014533	GGC	2	6	7506	7511	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	307591953
75	NC_014533	GAT	2	6	7554	7559	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	307591953
76	NC_014533	GCC	2	6	7579	7584	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	307591953
77	NC_014533	TTC	2	6	7593	7598	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	307591953
78	NC_014533	CGG	2	6	7769	7774	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	307591953
79	NC_014533	AGC	2	6	7815	7820	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	307591953
80	NC_014533	TTCGC	2	10	7822	7831	0 %	40 %	20 %	40 %	307591953
81	NC_014533	CGG	2	6	7873	7878	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	307591953
82	NC_014533	TTC	2	6	7941	7946	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	307591953
83	NC_014533	GTC	2	6	8118	8123	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	307591953
84	NC_014533	TTC	2	6	8184	8189	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	307591953
85	NC_014533	GAA	2	6	8317	8322	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	307591953
86	NC_014533	GAC	2	6	8392	8397	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	307591953
87	NC_014533	CGA	2	6	8420	8425	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	307591953
88	NC_014533	TCT	2	6	8428	8433	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	307591953
89	NC_014533	CGC	2	6	8505	8510	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	307591953
90	NC_014533	CGC	2	6	8562	8567	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	307591953
91	NC_014533	CCA	2	6	8573	8578	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	307591953
92	NC_014533	TC	3	6	8584	8589	0 %	50 %	0 %	50 %	307591953
93	NC_014533	GCT	2	6	8597	8602	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	307591953
94	NC_014533	TCT	2	6	8656	8661	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	307591953
95	NC_014533	CTT	2	6	8768	8773	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	307591953
96	NC_014533	TGGG	2	8	8796	8803	0 %	25 %	75 %	0 %	307591953
97	NC_014533	G	6	6	8858	8863	0 %	0 %	100 %	0 %	307591953
98	NC_014533	ATG	2	6	8877	8882	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	307591953
99	NC_014533	TCT	2	6	8920	8925	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	307591953
100	NC_014533	CCA	2	6	8993	8998	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	307591953
101	NC_014533	CTA	2	6	9292	9297	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	307591954
102	NC_014533	GTC	2	6	9452	9457	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	307591954
103	NC_014533	TTA	2	6	9480	9485	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	307591954
104	NC_014533	TTTG	2	8	9526	9533	0 %	75 %	25 %	0 %	307591954
105	NC_014533	TC	3	6	9584	9589	0 %	50 %	0 %	50 %	307591954
106	NC_014533	TTTGC	2	10	9601	9610	0 %	60 %	20 %	20 %	307591954
107	NC_014533	GTA	2	6	9630	9635	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	307591954
108	NC_014533	GA	3	6	9696	9701	50 %	0 %	50 %	0 %	307591954
109	NC_014533	TAA	2	6	9812	9817	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	307591954
110	NC_014533	GGA	2	6	9874	9879	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	307591954
111	NC_014533	ATC	2	6	9989	9994	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	307591954
112	NC_014533	CTT	2	6	10024	10029	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	307591954
113	NC_014533	AAT	2	6	10052	10057	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	307591954
114	NC_014533	CAT	2	6	10124	10129	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	307591954
115	NC_014533	GTT	2	6	10156	10161	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	307591954
116	NC_014533	GGC	2	6	10193	10198	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	307591954
117	NC_014533	CAA	2	6	10223	10228	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	307591954
118	NC_014533	AAT	2	6	10322	10327	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	307591954
119	NC_014533	T	6	6	10344	10349	0 %	100 %	0 %	0 %	307591954
120	NC_014533	TCC	2	6	10395	10400	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	307591954
121	NC_014533	AGG	2	6	10460	10465	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	307591954
122	NC_014533	AAC	2	6	10501	10506	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	307591954
123	NC_014533	TAC	2	6	10522	10527	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	307591954
124	NC_014533	TTA	2	6	10555	10560	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	307591954
125	NC_014533	CAAA	2	8	10639	10646	75 %	0 %	0 %	25 %	307591954
126	NC_014533	AATGCC	2	12	10667	10678	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	307591954
127	NC_014533	AT	3	6	10701	10706	50 %	50 %	0 %	0 %	307591954
128	NC_014533	GAA	2	6	10722	10727	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	307591954
129	NC_014533	CTA	2	6	10780	10785	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	307591954
130	NC_014533	ACTT	2	8	10793	10800	25 %	50 %	0 %	25 %	307591954
131	NC_014533	CAC	2	6	10807	10812	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	307591954
132	NC_014533	ACC	2	6	10911	10916	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	307591954
133	NC_014533	AGC	2	6	10925	10930	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	307591954
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141	NC_014533	ATC	3	9	11333	11341	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	307591954
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257	NC_014533	TGATT	2	10	18879	18888	20 %	60 %	20 %	0 %	307591957
258	NC_014533	CGG	2	6	18911	18916	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	307591957
259	NC_014533	AGA	3	9	18924	18932	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	307591957
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